2003년판의 호문쿨루스는 작중 특정 인물들의 인체연성이 실패하면서 태어난 부산물이다.

러스트

스카의 형이 죽은 자신의 연인을 인체연성하면서 태어남

엔비

반 호엔하임이 자신의 죽은 아들을 인체연성하면서 태어남

글러트니

2003년판 흑막이 현자의돌을 제조하기 위해 인위적으로 만들어냄

그리드

2003년판 흑막을 사랑했던 남자를 흑막이 꼬드겨서 인체연성 시켜버림

프라이드

역시 2003년판 흑막이 만들어낸 호문쿨루스

라스

엘릭형제의 선생인 이즈미 커티스가 죽은 자기 아들을 인체연성하면서 태어남

슬로스

엘릭형제가 죽은 어머니를 인체연성하면서 태어남