한때의 전투로부터 20년. 텐도 소우지의 행방은 지금도 묘연하다.
그리고 인류와 웜은 공존하는 길을 걷고 있었다.
그러나 왠지 ZECT는 비밀리에 새로운 마스크 드라이더 시스템을 개발하고 있었다.
그 자격자로 선정된 것은 카가미 아라타의 아들인 고등학생 유이.
ZECT의 미시마 마사토는 유이와의 접촉을 도모했지만

그걸 가로막기 시작한 것은 유이의 동급생인 텐도 히카루였다.
한편, 타도코로 슈이치로부터 정보를 얻은 카가미 아라타는, ZECT의 음모에 맞서기 위해, 과거의 동료들을 찾아가지만, 카자마 다이스케도, 야구루마 소우도, 카가미의 협력을 거부했다.
단 혼자서라도 적과 싸우는 각오를 결정한 카가미.
그런 그의 앞에, 의외의 인물의 그림자가…