U.C.0079., 지구권은 후일 “1년전쟁”이라고 불리는 전투 속에 있었다.지구연방군의 젊은 소위,시로 아마다는 지구에 부임하는 도중에지온군의 여자 파일럿,아이나 사하린과 전장에서 만난다. 적대 관계이면서도 매료되는 시로와 아이나. 그러나 두 사람은 각각의 입장에 묶여서 서로가 있어야 할 장소로 돌아갔다.

　지상의 코지마 대대에 착임한 시로는 제08MS소대의 대장이 된다. 반항적인 대원과의 갈등이나 익숙하지 않은 환경에서의 가혹한 임무. 다양한 어려움이 시로를 덮친다. 그러나, 그 장애를 극복하고, 대원에게 신뢰받는 소대장으로 성장해 가는 시로. 한편 아이나는 오라버니기니어스 사하린을 돕기 위해 지구로 내려섰다. 오라버니가 개발하는 비밀 무기아프사라스의 파일럿으로서 전장에 몸을 던지는 아이나.

　우주에서 끊어진 두 개의 유대를 전쟁이라는 비정한 현실이 연결하려고 했다.